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- 【小RNA测序】 miRNA-seq
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- 送样建议
小RNA主要包括miRNA、siRNA、snoRNA和piRNA等，是生命活动重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。由于小RNA测序技术的应用，越来越多的miRNA被发现和鉴定，并广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。
小RNA测序技术路线
测序方案
测序平台：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus测序模式：PE150
测序数据量：10 M raw reads
生物信息分析
基础分析
原始数据质控检查（碱基质量评估，序列质量评估）
比对结果质控检查
RNA种类分析统计
miRNA表达分析
基于miRNA表达的样品主成分分析
miRNA差异分析
差异 miRNA 靶基因预测
差异 miRNA 靶基因的GO功能分析
差异 miRNA 靶基因的KEGG通路分析
差异 miRNA 靶基因的Rectome通路分析
高级分析（可结合mRNA测序结果）
差异miRNA与差异表达基因调控分析
差异miRNA与差异表达基因网络绘图
部分结果展示
图1：外泌体中共表达和特异性表达的miRNAs维恩图
图2：火山图展示HFD-exos与NCD-exos的表达差异倍数
图3：miRNA靶基因网络图
Table1. miRNA-seq原始样本送样建议
送样类型
送样量
备注
细胞上清
≥30mL
无支原体污染
血清、血浆
≥4mL
Table2. miRNA-seq RNA样本送样建议
送样类型
送样量
完整性（RIN值）
浓度
其他
纯度
total RNA
≥1μg
≥7
≥100ng/μl
无DNA，蛋白/盐离子等污染，样本无色透明不粘稠
血清血浆、细胞上清、外泌体RNA
≥40ng
/
/
DV200>30%
FFPE组织RNA
≥4μg
≥3
/
DV200>30%
RIP RNA、pulldown RNA
≥200ng，如≤10ng,则采用微量建库
/
/
*更具体的送样方法请详询销售或技术支持
物种范围：人、小鼠、大鼠等物种，其余物种请详询销售或技术支持
广州市黄埔区开源大道11号科技企业加速器A区6栋2楼
geneseed@geneseed.com.cn