通过超声或酶处理将染色质随机切割，利用抗原抗体的特异性识别反应，将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来，再通过反交联释放结合蛋白的DNA片段，最后对目的DNA片断进行纯化与文库构建，通过高通量测序的方法获得蛋白质与DNA相互作用的信息。

染色质免疫共沉淀测序技术路线

测序方案
测序平台：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus

测序模式：PE150

测序数据量：10 Gb raw data

生物信息分析

基础分析

测序数据质量评估（碱基质量评估、序列质量评估）

比对结果质控检查

测序reads全基因组分布图

结合峰peak鉴定

结合峰基因元件分布可视化

富集peak的motif分析

高级分析（有不同处理条件分组样本）

差异结合峰检测分析

差异结合峰相关基因GO功能富集分析

差异结合峰相关基因KEGG生物通路富集分析

差异结合峰相关基因Reactome通路分析

部分结果示例

图1. peak 在转录起始位点上下游 3kb 的平均覆盖度

图2. peak 在染色体上的分布图

图3. De novo motif 分析结果

Table1.ChIP-seq DNA样本送样建议

*更具体的送样方法请详询销售或技术支持

物种范围：人、小鼠、大鼠，其他物种请详询销售或技术支持