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- 【RNA免疫共沉淀测序】 RIP-seq
- 产品介绍
- 结果展示
- 送样建议
运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，经过分离纯化获得结合在复合物上的RNA，再通过高通量测序实现对目的RNA的信息分析。RIP技术与高通量测序的结合，能帮助研究人员更好的了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。
RNA免疫共沉淀测序技术路线
测序方案
测序平台：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus测序模式：PE150
测序数据量：10 Gb raw data
生物信息分析
原始数据质控检查（碱基质量评估，序列质量评估）
比对结果质控检查
基因覆盖度分析
基于基因表达的样品主成分分析
富集基因表达分析
富集基因GO功能分析
富集基因KEGG通路分析
富集基因Rectome通路分析
富集环状RNA的预测及鉴定
富集circRNA宿主基因的GO功能分析
富集circRNA宿主基因的KEGG通路分析
富集circRNA宿主基因的Rectome通路分析
富集circRNA的靶向miRNA预测分析
富集circRNA及靶向miRNA网络调控制图
富集长链非编码RNA表达分析
富集lncRNA顺式调控基因的GO功能分析
富集lncRNA顺式调控基因的KEGG通路分析
富集lncRNA顺式调控基因的Rectome通路分析
部分结果示例
图1. 富集基因的GO功能分析展示
图2. 富集lncRNA的Reactome通路分析展示
图3. 富集circRNA-miRNA网络图展示
Table1. RIP-seq RNA样本送样建议
送样类型
送样量
完整性（RIN值）
浓度
纯度
RIP RNA
≥200ng，如≤10ng,则采用微量建库
/
/
无DNA，蛋白/盐离子等污染，样本无色透明不粘稠
*更具体的送样方法请详询销售或技术支持
物种范围：人、小鼠、大鼠，其余物种请详询销售或技术支持
广州市黄埔区开源大道11号科技企业加速器A区6栋2楼
geneseed@geneseed.com.cn