服务介绍
对微生物群体进行高通量测序,通过数据分析特定环境中微生物群体基因组成及功能,研究微生物多样性、种群结构、生物进化与环境之间的关系,解读微生物群体多样性与丰度,微生物与宿主之间的关系,发掘和研究新的、具有特定功能的基因,挖掘具有应用价值的基因资源,应用于开发新的微生物活性物质。
微生物宏基因组测序技术路线
测序方案
测序平台:Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus
测序模式:PE150
测序数据量:5-10 Gb raw data
生物信息分析
基础分析
物种组成和丰度统计
样品复杂度分析
样品间物种丰度差异分析
基因组组装
基因组组分分析
基因功能GO-COG注释
基因功能KOG、KEGG注释
自定义分析
多样品显著相关因子分析
与疾病相关的基因的深度分析
菌群共生关系网络构建
系统进化树构建
Table1.宏基因组测序原始样本送样建议
送样类型 | 送样量 | 备注 |
粪便、土壤等环境样本 | ≥2g |
Table2.宏基因组测序DNA样本送样建议
送样类型 | 送样量 | 浓度 | 纯度 |
DNA | ≥4μg | ≥30ng/μl | 无蛋白/盐离子等污染 |
*更具体的送样方法请详询销售或技术支持
物种范围:常见有参微生物,详询销售或技术支持