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  • 宏基因组测序(Metagenomics)

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    对微生物群体进行高通量测序,通过数据分析特定环境中微生物群体基因组成及功能,研究微生物多样性、种群结构、生物进化与环境之间的关系,解读微生物群体多样性与丰度,微生物与宿主之间的关系,发掘和研究新的、具有特定功能的基因,挖掘具有应用价值的基因资源,应用于开发新的微生物活性物质。

    60 宏基因组.png

    微生物宏基因组测序技术路线



    测序方案


    测序平台:Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus

    测序模式:PE150

    测序数据量:5-10 Gb raw data





  • 生物信息分析

    基础分析

    物种组成和丰度统计

    样品复杂度分析

    样品间物种丰度差异分析

    基因组组装

    基因组组分分析

    基因功能GO-COG注释

    基因功能KOG、KEGG注释

     

    自定义分析

    多样品显著相关因子分析

    与疾病相关的基因的深度分析

    菌群共生关系网络构建

    系统进化树构建




  • Table1.宏基因组测序原始样本送样建议

    送样类型

    送样量

    备注

    粪便、土壤等环境样本

    ≥2g


    Table2.宏基因组测序DNA样本送样建议

    送样类型

    送样量

    浓度

    纯度

    DNA

    ≥4μg

    ≥30ng/μl

    无蛋白/盐离子等污染


    *更具体的送样方法请详询销售或技术支持


    物种范围:常见有参微生物,详询销售或技术支持



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