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ChIP-seq
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服务介绍
通过超声或酶处理将染色质随机切割，利用抗原抗体的特异性识别反应，将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来，再通过反交联释放结合蛋白的DNA片段，最后对目的DNA片断进行纯化与文库构建，通过高通量测序的方法获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
染色质免疫共沉淀测序技术路线
测序方案
测序平台：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus测序模式：PE150
测序数据量：8-10 Gb raw data
生物信息分析
基础分析
测序数据质量评估（碱基质量评估、序列质量评估）
比对结果质控检查
测序reads全基因组分布图
结合峰peak鉴定
结合峰基因元件分布可视化
富集peak的motif分析
高级分析（有不同处理条件分组样本）
差异结合峰检测分析
差异结合峰相关基因GO功能富集分析
差异结合峰相关基因KEGG生物通路富集分析
差异结合峰相关基因Reactome通路分析
部分结果示例
图1. peak 在转录起始位点上下游 3kb 的平均覆盖度
图2. peak 在染色体上的分布图
图3. De novo motif 分析结果
Table1.ChIP-seq DNA样本送样建议
送样类型
送样量
浓度
纯度
ChIP DNA/ChIRP DNA
≥20ng
≥0.2ng/μl
无蛋白污染
*更具体的送样方法请详询销售或技术支持
物种范围：人、小鼠、大鼠，其他物种请详询销售或技术支持
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