Polysome-seq

服务介绍

核糖体是大部分细胞中体积最大的大分子之一，密度较高，基于这些特点，Polysome-seq利用蔗糖梯度超速离心法可分离游离、结合40S核糖体小亚基、结合60S核糖体大亚基或结合单/多个核糖体的mRNA分子。将上述感兴趣的各个组分的溶液进行浓缩、提取RNA，然后通过高通量测序分析，能有效地分析翻译组，如翻译效率、非编码RNA的翻译或与翻译调控高度相关的非翻译区（UTRs），有利于研究从RNA到蛋白之间的翻译水平调控机制。

技术应用

① 准确检测蛋白翻译效率；

② 分析目标RNA降解、翻译起始和抑制等机制，研究翻译调控与基因表达；

③ 挖掘潜在翻译的非常规RNA，如lncRNA、circRNA的翻译。

技术优势

① 蔗糖梯度密度离心分离多聚核糖体和单核糖体，更准确获取目标翻译研究对象的数据；

② 直观反映动态翻译状态；

③ 可鉴定mRNA上核糖体的结合情况；

④ 获取翻译中的RNA较长片段，有利于研究非编码区、lncRNA、circRNA等非常规RNA的翻译。

吉赛Polysome-seq技术服务项目

翻译组重构控制饮食及其对肿瘤发生的影响

标题：Remodelling of the translatome controls diet and its impact on tumorigenesis

发表期刊：Nature

发表时间：2024年8月14日

利用高通量测序技术（PolyRibo-seq），分析小鼠模型肝脏在禁食状态下的翻译组变化。使用肝脏组织样本进行多聚核糖体超速离心分级分离，得到含有不同数量核糖体的mRNA。将分离出的mRNA进行纯化，并用于建文库测序。研究显示在禁食期间，全局翻译下降，肝脏细胞选择性地重构翻译组。

c. 蔗糖梯度分离喂食和禁食24 h的WT肝裂解物的代表性多聚核糖体图谱。无翻译或低翻译部分(2-7)和多聚核糖体部分(8-13)用于PolyRibo-seq；

d. 空腹时转录本翻译效率(TE)的log2倍变化(FC)火山图。红点表示翻译水平显著上调的基因；

e. 以Wiki通路为基础，富集了翻译显著上调的基因；

f：在喂食和禁食的WT肝脏蔗糖梯度部分，指示mRNA分布的百分比。