Polysome profiling 实验,是利用核糖体沉降系数较大的特性,用蔗糖密度梯度离心的方法分离多聚核糖体。由于核糖体是细胞里密度最高的生物大分子,一条 mRNA 上结合的核糖体越多,在蔗糖密度梯度离心时的沉降速率越快,因此结合不同数量核糖体的mRNA 通过离心在溶液中会被分开。离心结束后将蔗糖溶液由底部缓慢抽出,即可对结合有不同数量核糖体的组分进行分离,可以直观地反映细胞内翻译的状态。
Polysome profiling 是一种翻译组学的研究方法,其操作流程为先用放线菌酮或氯霉素处理样本,然后裂解细胞,离心并取上清液,之后将上清液转移至蔗糖梯度上进行超离。最后,进行核糖体检测及分离。研究人员可根据实验需要,继续做 PCR 定量分析、蛋白质提取等实验。
Polysome profiling实验流程概要(source:Su D, et al., 2024)