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    引物是人工合成的两个寡核苷酸序列(F和R):F端引物与靶区域N端的DNA模板链互补,R端引物与靶区域C端的DNA模板链互补,其功能是作为核苷酸聚合作用的起始点,合成新的核酸链。

     

    吉赛生物可提供:

    1. circRNA/mRNA/lncRNA/miRNA,多种RNA引物设计合成;

    2. circRNA成环验证;

    3. circRNA RNase R耐受验证;

    4. 基因qPCR检测。



    技术优势


    1. 准确性:可根据基因的特殊构象位置进行引物设计;

    2. 特异性:熔解曲线单峰,扩增产物与目的基因相符;

    3. 专业性:由专业人员进行设计,并通过实验严格验证引物的特异性。




    客户提供


    基因ID/物种/全长。




    我们提供

     

    1.定制化设计合成的引物,2OD;

    2. 引物设计或验证的实验报告。




  • 引物设计验证

    1:引物扩增曲线、溶解曲线



    2qPCR产物琼脂糖凝胶电泳



    3qPCR产物测序结果


  • 1. 怎么提取和逆转录circRNA ?

    常用细胞组织等样品提取total RNA,其中包含mRNA、lncRNA、miRNA和circRNA等所有的RNA种类,暂没有方法直接提取circRNA。但可以对total RNA进行RNase R消化处理,以使circRNA得到富集。

     

    total RNA或RNase R处理的RNA进行逆转录,应使用随机引物,不能使用oligo(dT),因为circRNA没有polyA尾。逆转录过程中circRNA模板是呈环形的,逆转录的cDNA第一链是线性的单链DNA,后续的PCR产物是线性的双链DNA。

     

    2. 如何针对外显子环化的circRNA和内含子环化的circRNA设计引物?

    外显子环化的circRNA设计引物时需要特异性地针对环化位点处来设计引物。而内含子环化的circRNA,既可跨环化位点设计引物,也可围绕内含子区域设计引物。

     

    3. 做circRNA逆转录的时候,是否可以单独用Oligo(dT)引物来逆转?

    不可以。circRNAs是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴,并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子

     

    4.如何确定引物的特异性?

    由于circRNA的结构特殊性,引物设计出来之后,还需要做qPCR实验来验证引物的特异性。确定circRNA引物的特异性主要有以下3步:

    a.溶解曲线:溶解曲线单峰,Tm值在正常范围之内

    b.电泳图:电泳条带单一,条带大小正确

    c.Sanger测序:测序结果单峰,环化位点正确

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