Polysome profiling

服务介绍

Polysome profiling 实验，是利用核糖体沉降系数较大的特性，用蔗糖密度梯度离心的方法分离多聚核糖体。由于核糖体是细胞里密度最高的生物大分子，一条 mRNA 上结合的核糖体越多，在蔗糖密度梯度离心时的沉降速率越快，因此结合不同数量核糖体的mRNA 通过离心在溶液中会被分开。离心结束后将蔗糖溶液由底部缓慢抽出，即可对结合有不同数量核糖体的组分进行分离，可以直观地反映细胞内翻译的状态。

实验流程方法

Polysome profiling 是一种翻译组学的研究方法，其操作流程为先用放线菌酮或氯霉素处理样本，然后裂解细胞，离心并取上清液，之后将上清液转移至蔗糖梯度上进行超离。最后，进行核糖体检测及分离。研究人员可根据实验需要，继续做 PCR 定量分析、蛋白质提取等实验。

Polysome profiling实验流程概要（source：Su D, et al., 2024）

技术应用

① 准确检测蛋白翻译效率；

② 分析目标RNA降解、翻译起始和抑制等机制，研究翻译调控与基因表达；

③ 挖掘潜在翻译的非常规RNA，如lncRNA、circRNA的翻译。

技术优势

① 直观反映翻译状态：Polysome profiling技术能够直观地反映细胞和组织内的翻译状态，通过分析不同组分中mRNA的分布，可以了解特定mRNA的翻译活跃程度；

② 有助于理解翻译动态变化：Polysome profiling能够检测翻译中发生巨大变化的RNA，结合测序技术，有助于理解在不同生理或病理状态下翻译动态的变化。

升级版Polysome profiling plus服务内容

①增加组分：基础版Polysome profiling可根据沉降系数大小，把核糖体-RNA复合物分离成5个组分，而升级版Polysome profiling提供共18个分离的组分，可增加RT-qPCR数据点，绘制更详细的翻译动态折线图，更精准反映翻译活性的动态变化；

②增加RNA质控：检测RNA完整性，确保下游的分析。如送样不均衡，可根据质检结果进行相对等量上机(但不一定准，因为复合物含核酸和核糖体、蛋白等)

③能处理的样本类型增多：包括细胞、组织、细菌、真菌菌体等。

④统计AUC值：P/non-P ratio常用于表征样品整体的翻译活性

吉赛翻译组技术服务内容

                                                                   Polysome Profiling图谱示例

升级版Polysome profiling提供AUC值统计（P/non-P ratio），常用于表征样品整体的翻译活性

例：

Polysome profiling原始样本送样建议

*具体处理、保存和运输方法请咨询技术支持。

物种范围：请咨询销售或技术支持