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  • Polysome-seq

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  • 服务介绍

    核糖体是大部分细胞中体积最大的大分子之一,密度较高基于这些特点,Polysome-seq利用蔗糖梯度超速离心法可分离游离、结合40S核糖体小亚基、结合60S核糖体大亚基或结合单/多个核糖体的mRNA分子。将上述感兴趣的各个组分的溶液进行浓缩、提取RNA,然后通过高通量测序分析能有效分析翻译组,如翻译效率、非编码RNA的翻译或与翻译调控高度相关的非翻译区(UTRs)有利于研究从RNA到蛋白之间的翻译水平调控机制




    技术应用

    ① 准确检测蛋白翻译效率;

    ② 分析目标RNA降解、翻译起始和抑制等机制,研究翻译调控与基因表达;

    ③ 挖掘潜在翻译的非常规RNA,如lncRNA、circRNA的翻译。

     

    技术优势

    ① 蔗糖梯度密度离心分离多聚核糖体和单核糖体,更准确获取目标翻译研究对象的数据;

    ② 直观反映动态翻译状态;

    ③ 可鉴定mRNA上核糖体的结合情况;

    ④ 获取翻译中的RNA较长片段,有利于研究非编码区、lncRNA、circRNA等非常规RNA的翻译。

     

    吉赛Polysome-seq技术服务项目




    服务项目

    吉赛提供

    Polysome Profiling(无测序)

    5个组分的图谱

    Polysome Profiling-RNA(无测序)

    图谱中5个组分RNA

    Polysome-seq(单文库)

    组分⑤测序分析结果

    Polysome-seq(双文库)-Light+Heavy

    Light(组分++++Heavy(组分测序分析结果

    Polysome-seq  (双文库)-Free+Binding

    Free(组分+Ribosome Binding(组分+++测序分析结果

    Disome-seq  (单文库)

    组分中的Disome(无图谱)测序分析结果








  • 翻译组重构控制饮食及其对肿瘤发生的影响

    标题:Remodelling of the translatome controls diet and its impact on tumorigenesis

    发表期刊:Nature

    发表时间:2024年8月14日

     

    利用高通量测序技术(PolyRibo-seq),分析小鼠模型肝脏在禁食状态下的翻译组变化。使用肝脏组织样本进行多聚核糖体超速离心分级分离,得到含有不同数量核糖体的mRNA。将分离出的mRNA进行纯化,并用于建文库测序。研究显示在禁食期间,全局翻译下降,肝脏细胞选择性地重构翻译组。

     

     


    c. 蔗糖梯度分离喂食和禁食24 h的WT肝裂解物的代表性多聚核糖体图谱。无翻译或低翻译部分(2-7)和多聚核糖体部分(8-13)用于PolyRibo-seq;

    d. 空腹时转录本翻译效率(TE)的log2倍变化(FC)火山图。红点表示翻译水平显著上调的基因;

    e. 以Wiki通路为基础,富集了翻译显著上调的基因;

    f:在喂食和禁食的WT肝脏蔗糖梯度部分,指示mRNA分布的百分比。